校本部

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以化学方法訓練學生學習研讀醫藥相關科學的系所，醫藥化学組偏重醫藥及其應用相關的化学研究，凡與藥品研發合成、生醫材料、生醫與食品檢測、生物體內的化学反應…等等，都是本系/組研究的方向。本系強調實作，研究風氣盛行，研究成果備受肯定。在2018-2022的Nature Index（自然指數）分析中，本學系在台灣之化学領域排名第5-10名，私立大學之首。

本系注重化学基礎教育，也積極培養化学及生物醫學跨領域的人才，學生畢業後除可以朝化学、半導體相關產業發展，也可以結合生醫知識，朝醫藥、生技、藥妝品或保健科技等。

醫藥化学組偏重醫藥化学相關的化学研究，學習藥品研發合成、生醫材料與食品檢測技術、從化学分子微觀角度理解及研究各項醫學疾病治療的原因與解決之道。

本系以五大化学主科包含：有機化学、分析化学、無機化学、物理化学與生物化学作為學習基礎，並輔以醫藥應用相關課程培育學生；讓學生除了有扎實的化学知識及技能外，也可以了解生物醫學領域的內涵，進行跨域學習，建立學生穩固的化学專業基礎並有能力與醫藥生技與材料進行跨領域溝通合作及應用。

1. 數理課堂中了解原理並練習發問。
2. 實驗課程中仔細觀察, 思考並紀錄。

本系欢迎具备科学家特质、喜欢追求原理、愿意突破现状的高中生就读，能接受新的及未知的挑战、情境或学习内容；逻辑推导能力强，思考形式弹性活泼；懂得独立思考、判断、分析各方资讯，并能专注投入科学实验，是本系学生必要配备。

本系醫藥化学組比一般大學化学系更著重於訓練學生在藥物開發與合成的專業。醫藥化学組主要是訓練學生從化学的角度觀察並思考生物化学、藥物設計、合成、作用機轉、鑑定等專業知能，旨在培育具新藥設計與合成相關專長之化学家，在學習的過程中會著重於有機合成等相關知識。
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有別於傳統化学系，本系以化学學科作為學習基礎，結合學校強大的生物醫學教學及研究資源，培養化学及生物醫學相關領域的跨域人才。如本系有生物化学、生醫感測、藥物化学、医药品设计与合成、生物統計學、生醫藥妝學及毒物及農藥檢測等相關必選修課程，提供學生豐富的醫藥與化学相關學習資源，未來學生的出路將會更廣。

雖然諾貝爾做炸藥賺了很多錢，不過化学的不是只能做炸藥而已。化学是現代科學的根基，基礎打得好，可應用在各類產業。醫藥暨應用化学系非僅限醫藥相關產業，出路比一般化学系與醫藥相關科系更為寬廣，除生技製藥外，高科技產業研發（如台積電）亦可勝任。
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化学系為非證照科系，不用證照，高科技、半導體、生醫材料、製藥產業及特用化学品等諸多產業對化学系人才的需求很大，薪資也相較於一般產業要高，若是具有碩博士學位，升遷更容易當然薪資也高很多。
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化学是所有科學的根基，換句話說，學化学只要基礎打得好，其實可以應用在所有的產業以及學科上。系上鼓勵學生跨領域學習、積極參與老師研究，為未來生涯累積基礎。
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化学是基礎科學，課程並非只是理論學習，實驗和實務操作在課程中也佔有重要地位，學好化学未來將可以很容易跨到化工、材料、生命科學及生技醫藥等領域。本系結合了化学、醫學及生物科學等領域的知識，強調整合性學習。

本系學生訓練強調實作，研究風氣盛行，研究成果備受肯定。在2018-2022的Nature Index（自然指數）分析中，本系在台灣之化学領域排名第5-10名，私立大學之首。本系成立於民國79年，並於89年及93年分別成立碩士班及博士班，迄今超過2000名畢業生，分別在學術界、生技製藥業與高科技行業中嶄露頭角。
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隨著時代潮流及產業脈動的快速更迭，化学依然有著不可被取代的地位與重要性，本來的出路已經相當不錯，而本系致力於整合學校既有的生物醫學領域的教學及研究強大能量，建置一個能夠讓學生跨領域學習的場域，讓學生於畢業後有更多的產業選擇，有更強的能力可以與他人競爭、合作及領導，擁有更多成功的機會。