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慈济大学医学系的教育目的為培養術德兼修、關懷生命、擁有大愛與利他之情懷，善於溝通、重視團隊合作，樂於承擔社會責任，並具備主動及終身學習的能力，以奠定医学生成為良醫之基礎。
教學特色：1.「无語良師」課程；2. 系統模組化教學； 3. 精緻的臨床技能中心；4. 跨院區整合之教學、研究；5.典範的床邊教學。

本系位於全國最卓越的綜合型大學医学院中，有最優秀的師資提供多元化的學習課程及最精密的教學研究設備，同時擁有医学中心及社區化的临床实习機構，提供學生最優良的學習環境。
本系之教育目的：培育良醫、服務社會、領導醫界、貢獻?類。畢業生遍及本島及世界各大医学中心，造就眾多國家級的一流學者、國內外无數的一流臨床医师、傑出研究人才及医学教育家，是國內最熱門的科系。

医学系修業年限為六年，課程以四大架構規劃-1.醫預科階段：基礎科學的紮根；2.基礎医学：以器官系統導向之模組，基礎医学搭配臨床情境之介紹，以銜接臨床課程；3.临床实习：一般医学核心能力，增加病人照護學習；4.医学人文：整合不同深度及內涵之医学人文、倫理及溝通。

医学系修業年限為六年，畢業後授予医学士學位。
本系為進行有關医学教育的應用科學學系，教導學生修習大學共同課程、通識課程、基礎医学課程、臨床医学課程，並提供完整的臨床各科部實習，以期學生畢業時能具有大學學生的基本知能及一定的診斷、治療和預防生理、心理疾病的專業能力。

强化基础科学知识，训练组织推理与多元思考能力，培养自主学习、主动积极的思维与态度，加强英语阅读理解能力，尝试同理他人心理，培养关怀尊重生命、成就大我的态度。

1.
经年累月的、心无旁鶩的持续阅读
2.
身边随时会有好朋友可以和自己脑力激盪、互相讨论、切磋
3.
学习汇整相关的知识、记忆，融会贯通
4.
知其然，更要知其所以然
5.
物有本末、事有始终，要能追根究柢，也要能触类旁通

医学系畢業生具有報考医师執照國家考試資格，通過國家考試取得医师資格後可從事醫療工作，實際執行醫療行為；医学科學及生命科學相關科系則多以從事生物医学相關研究工作為主。

医学系的學習內容包括基礎科學及臨床医学，學生畢業後可參加國家医师考試，取得医师證書。工作上有多元的專科選擇，例如內科、外科、婦產科、小兒科、急診科、各臨床科系等。

一般人可能認為医学系畢業生只能擔任医师的行業，其實不然，許多医师也致力於教育，學術研究，生醫創新，甚至人道救援等面向，成為各領域之菁英；但是要擔任医师，絕對需要就讀医学系並順利畢業。

本系畢業生除畢業後經過多年住院医师訓練成為主治医师，肩負起照顧人們健康重任外，同時也可在医学院擔任基礎或臨床的教師或研究員；未來也可投身進入公共衛生相關領域，成為政府衛生行政官員或大型醫院管理者；亦可進入目前最熱門的生物科技產業企業進行研發工作。

外界常以為一進入医学系就讀，便需要選擇未來所要從事的醫療專科。實際不然，医学系修業規劃為期6年，內容包含基礎医学與臨床医学相關知識與技能的學習，在實習階段，医学生仍需經歷各主要臨床科別的學習，期間可以依興趣自選部份科別實習，畢業後也需接受包含各主要臨床科別畢業後一般医学訓練後，才會決定執業專科領域。

1.
在学习内容上各科有其专业知识，一个症状可能源自不同病因。
2.
本系採?器官系统整合教学授课?法，同时探讨不同器官组织系统间彼此影响，与?般?学教学?法完全不同。另外由於科技的进步，需有主动学习的热诚与时俱进。

慈济大学医学系雖為宗教團體支持所建立的大學，僅將宗教的濟世救人的情懷作為學習與涵養的內涵，因此入學與畢業門檻皆无宗教要求或限制，慈济大学的眾多師長，包括前任校長，以及臨床医师皆非佛教徒，慈济大学為師生多元化的綜合大學。

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