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体育研究所碩士班成立於民國92年，体育学系於民國94年設立，民國95系所合一，民國112學年度起成為師培並行學系，規劃運動教育、運動管理與休閒、运动教练與指導、体育教學、体育行政等專長領域。主要為培育學生對運動教育與体育教學之研究能力，及培育國小体育及雙語師資、運動教育及運動產業經營管理卓越人才為目標。未來並將繼續加強師資、規劃多元課程及增添各項設備，並朝多元化方向發展。

本系秉持本校「雙核心」菁英之養成教育，一方面延續學校培育体育優秀師資傳統，一方面因應運動就業環境之社會變遷，以多元特色系所發展，培育体育運動社會人才，發展成為南部優質的一流体育師資及運動專業人才培育系所為目標。

本系系名所成為的學科定義，除傳統「体育即是透過身體活動達到教育的目的」外，配合時代演進，擴大涵括「体育」、「運動」與「身體活動」三方之知識本質，成為「探討一切以身體活動為基礎的知識體系」。

本系是以运动科学及运动社会学领域，如:运动生理学、运动心理学、运动教育学、运动管理学、运动解剖学、运动伤害防护等為学科基础，并以运动竞技类别，如:田径、体操、舞蹈、游泳、国术、各项球类运动為术科专业能力。

精熟学习：学习各种运动种类的技能。（持續專注練習訓練）
学科讲授：教师授课除以传统板书、投影片进行口授讲述外，部分课程并辅以术科实地操作、小组讨论研究、个别指导等方式进行。同时配置教学助理以协助教师授课，并辅以定期举办演讲、专题讨论等多元方式，依课程性质弹性实施教学。（專注練習訓練）
实习法：邀请产官学等专家蒞校演讲，让学生能更深一层认识与产业之关连，并与相关产业合作实习，使学生能早一步瞭解职场之现况，以利学生未来生涯之规划。（人際關係溝通增進）

本系所的課程是以理論與實務並重，所以体育基本專業課程與大眾化的運動技能規劃於一、二年級修習，以建立穩固之理論基礎，三、四年級則趨向專業實務課程，期能培育文武兼備的体育專才。而現今体育運動產業蓬勃發展，本系也逐漸轉型，未來出路除了一般傳統的培育中、小學体育教師外，也鼓勵同學們可以朝運動產業、專任教練、防護員、選手…等發展，因此，也建議對本科系有興趣之同學，除了術科能力的加強外，也可以多了解目前体育運動的發展，越早開始思考要往哪一方面發展越好，當然每一條路都很辛苦，但只要想要，並願意努力，那這條路就會為您所開。

其他相關科系（如：休閒、健康、觀光休閒、運動產業、競技）較著重應用層面及培養單一領域人才。本系涵括之領域較它系多元，包含体育教學、体育行政、運動管理與休閒、运动教练與指導，以提供學生多元學習環境及培養學術兼備為重點，重視實作與應用層面，同時要求學生對各學科的理論意涵做正確理解，培育体育運動領域全方位及領導人才。

体育学系與運動休閒系、運動競技系等相關科系的差別，体育学系在課程設計上除培養体育教師、運動優秀人才外，也培育休閒及健身運動指導人才及運動科學相關研究人才。運動休閒系以運動與休閒產業之企劃、經營與推廣為主：運動競技系主要培育優秀運動選手及專業競技运动教练，且進行提升競技運動之科學研究，以強化國家運動競技實力，增強運動競技能力，以提昇國家國際形象與表現。

主要為培育學生對運動教育與体育教學之研究能力，及培養從事体育研究的專業人才與体育運動產業經營管理的專業人才。

体育学系畢業不只可以當中小学教师或体育研究人員，其畢業後出路多元化，如:体育行政公職人員、运动教练、運動指導人才、運動裁判、運動防護員、運動產業經營管理人才、幼兒體能老師、個人工作室等。

本系實務與理論兼備，但体育学系的學習內容，會使高中生以為只要練習运动术科即可。

一般人覺得讀体育学系只要運動能力好就可以，這是錯誤的觀念，就讀体育学系不只要奠定學科的基礎，如:运动生理学、运动心理学、运动生物力学等，也要有專業的術科能力，如田徑、游泳、體操、各項球類項目等，在學術科並重下，才能成就一位專業的体育人。
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本系課程設計除了培養体育教師及運動優秀人才外，更擴展到培育休閒及健身運動指導人才及運動科學相關人才。

体育学系需有基礎體能表現，必須參加大學体育術科考試。